Instytut Zoologii i Badań Biomedycznych
Spektralny sorter komórek Aurora CS (Cytek, USA)
- Udostępnienie:
- Dla pracowników i studentów Instytutu Zoologii i Badań Biomedycznych oraz Małopolskiego Centrum Biotechnologii: bezpłatnie po wcześniejszym uzgodnieniu,
- Dla pozostałych według różnych scenariuszy: współpraca, stawki godzinowe, prace zlecone.
- Lokalizacja: IZiBB, pok. 3.23
- Osoba do kontaktu: Michał Bochenek (michal.bochenek@uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: Analizy cech komórek, mikropęcherzyków oraz exosomów przy użyciu markerów fluorescencyjnych. Sortowanie przyżyciowe badanych komórek.
Pracownia Genetyki i Ewolucjonizmu
System do komputerowo wspomaganej analizy nasienia (CASA) (Hamilton-Thorne, CEROS, ver. 10.)
- Udostępnienie: współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: IZiBB, pok. 3.06
- Osoba do kontaktu: Paweł Grzmil (pawel.grzmil@uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: Pomiar parametrów ruchliwości plemników: VCL, VSL, VAP, ALH, BCF i LIN. Aparat ustawiony na plemniki myszy i nornic, ale po dostosowaniu możliwość pomiaru plemników innych gatunków (po przetestowaniu).
Zestaw mikromanipulatorów Narishige (para mikromanipulatorów precyzyjnych MMO-202 z pompkami, Para mikromanipulatorów zgrubnych MMN-1)
- Udostępnienie: współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: IZiBB, pok. 3.05
- Osoba do kontaktu: Zbigniew Polański (zbigniew.polanski@uj.edu.pl)
Mikroiniektor piezolelektryczny Primetech Piezo Impact MicroManipulator PMM-150FU
- Udostępnienie: współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: IZiBB, pok. 3.05
- Osoba do kontaktu: Zbigniew Polański (zbigniew.polanski@uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: Mikrochirurgia na oocytach i zarodkach preimplantacyjnych (nuclear transfer, zapłodnienie in vitro metodą ICSI, etc). Możliwość selektywnego pobierania komórek określonego typu z zawiesiny.
Luminometr SpectraMaxL (Molecular Devices)
- Udostępnienie: współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: IZiBB, pok. 3.03
- Osoba do kontaktu: Paweł Grzmil (pawel.grzmil@uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: Pomiar luminescencji w płytce 96-cio dołkowej (Luciferase assay).
Termocykler do ilościowej analizy kwasów nukleinowych Quant Studio 5 (Applied Biosystems)
- Udostępnienie:
- Dla pracowników i studentów Instytutu Zoologii i Badań Biomedycznych bezpłatnie po wcześniejszej rezerwacji terminu,
- Dla pozostałych według różnych scenariuszy: współpraca, prace zlecone. Możliwa samodzielna obsługa po przeszkoleniu.
- Lokalizacja: IZiBB, pok. 3.23
- Osoba do kontaktu: Sylwia Herman (sylwia.herman@doctoral.uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: Analiza ilościowa kwasów nukleinowych zarówno z zastosowaniem sond TaqMan jak i SybrGreen. Możliwość zastosowania także innych barwników po wcześniejszym przetestowaniu.
Zakład Immunologii Ewolucyjnej
Zebrafish core facility (Tecniplast – systemy do hodowli)
- Udostępnienie: Współpraca lub odpłatnie (warunki dostępne pod adresem: http://www.izibb.binoz.uj.edu.pl/jednostka-new/zebrafish-core-facility
- Lokalizacja: zwierzętarnia ZIE (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Krzysztofa Rakus (krzysztof.rakus@ujedu.pl)
- Możliwości badawcze: Dostęp do larw i dorosłych osobników danio pręgowanego (Danio rerio, ang. zebrafish) oraz prowadzenie badań z wykorzystaniem tego laboratoryjnego organizmu modelowego. W obrębie Zebrafish Core Facility utrzymywane są linie dzikie oraz linie transgeniczne danio pręgowanego.
System analizy behawioru danio pregowanego (Noldus)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: zwierzętarnia ZIE (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Krzysztofa Rakus (krzysztof.rakus@ujedu.pl)
- Możliwości badawcze: Analiza behawioru larw i osobników dorosłych danio pregowanego
Mikroskop konfokalny (Zeiss)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: ZIE (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Tomasz Prajsnar (tomasz.prajsnar@ujedu.pl)
Mikroskop fluorescencyjny (Zeiss)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: ZIE (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Tomasz Prajsnar (tomasz.prajsnar@ujedu.pl)
Cytometr przepływowy (Cytek)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: ZIE (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Joanna Homa (joanna.homa@ujedu.pl)
RotorGene – analiza ekspresji genów (Qiagen)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: ZIE (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Krzysztofa Rakus (krzysztof.rakus@ujedu.pl)
Czytnik płytek z fluorescencją (Tecan)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: ZIE (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Krzysztofa Rakus (krzysztof.rakus@ujedu.pl)
Doświadczenie: Badania z zakresu immunologii na modelu danio pregowanego (larwy i osobniki dorosłe), karpiu, tilapii oraz dzdżownicach. Badania interakcji układów odpornościowego i neuroendokrynnego. Analizy w mikroskopowe, w tym przyżyciowa mikroskopia konfokalna. Badania in vivo i in vitro fagocytów. Modele infekcyjne (bakteryjne i wirusowe) i nieinfekcyjne modele zapalenia. Analizy cytometryczne, testy kolorymetryczne, ELISA.
Pracownia Fizjologii i Toksykologii Rozrodu
Analizator do przyżyciowego oznaczania metabolizmu komórkowego: Agilent Seahorse XF HS Mini Analyzers
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: PFiTR (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Anna Ptak, anna.ptak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: Analizator umożliwiający prowadzenie kompleksowych badań szlaków metabolicznych, procesów katabolicznych i anabolicznych, czy też analiz zapotrzebowania i wykorzystania surowców energetycznych przez nienaruszone i w pełni funkcjonalne komórki. Umożliwia równoczesny pomiar stopnia zużycia tlenu (oxygen consumption rate - OCR) i stopnia zakwaszenia pozakomórkowego (extracellular acidification rate - ECAR) w żywych komórkach, prowadzony w czasie rzeczywistym. Pomiar prowadzony w czasie rzeczywistym, przyżyciowo, w komorach w układzie płytek wielodołkowych.
Mikroskop fluorescencyjny odwrócony (Zeiss)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: PFiTR (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Anna Ptak, anna.ptak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: Mikroskop umożliwia obrazowanie komórek bezpośrednio na płytkach/naczyniach hodowlanych (plastikowych)
StepOne Real-Time PCR System (Applied Biosystems) – aparat do qPCR
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: PFiTR (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Agnieszka Rak, agnieszka.rak@uj.edu.pl
Varioskan LUX 40 (ThermoFisher) - czytnik płytek do pomiaru fluorescencji, luminescencji i absorbancji
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: PFiTR (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Agnieszka Rak, agnieszka.rak@uj.edu.pl
ChemiDoc Imaging System (BioRad) - system wizualizacji żeli i membran
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: PFiTR (IZiBB)
- Osoba do kontaktu: Agnieszka Rak, agnieszka.rak@uj.edu.pl
Zakład Biologii i Obrazowania Komórki
ESCO CelCultrure CO2/O2 inkubator (ESCO, USA)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli komórkowych
- Osoba do kontaktu: Grzegorz Tylko, grzegorz.tylko@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: Inkubator do hodowli komórek in vitro z funkcją hipoksji - Inkubator kontroluje temperaturę, wilgotność, poziom CO₂ od 0% do 20% oraz stężenie O2 1% do 20,7% i wilgotności do 97%; prace eksperymentalne w hodowli in vitro w zakresie biologii komórki, mikrobiologii i biologii molekularnej; zastosowanie obejmuje też inżynierię tkankową, zapłodnienie in vitro, neurobiologię, badania nad rakiem i inne
CytoSMART LUX 2 (Niderlandy)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania, dostęp do kalendarza urządzenia on-line po uprzednim zgłoszeniu
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli komórkowych
- Osoba do kontaktu: Grzegorz Tylko, grzegorz.tylko@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: Rejestracje obrazów kultur komórkowych w określonym przedziale czasu od minuty do tygodni; automatyczne powiadomienia, graficzne przedstawienie danych dotyczące podziału komórek, monitorowania wzrostu i konfluencji komórek, zachowanie komórek macierzystych, chemotaksji.
Zeiss Axiovert 40 CFL (Zeiss, Niemcy)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium hodowli komórkowych
- Osoba do kontaktu: Grzegorz Tylko, grzegorz.tylko@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: Rejestracje obrazów kultur komórkowych w jasnym polu, kontraście fazowym i fluorescencji w przedziale wzbudzania/emisji dla DAPI, FITC oraz rodaminy; kamera cyfrowa AxioCam 208 color (Zeiss, Niemcy) obsługiwana przez oprogramowanie ZEN
Czytnik płytkowy SpectraMax iD3 Multi-Mode Microplate Reader, umożliwiający odczyty w szerokim
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium biochemiczne
- Osoba do kontaktu: Anna M. Osyczka, anna.osyczka@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: zakresie światła widzialnego, luminescencji i fluorescencji, tj. Abs: 230 - 1000 nm; FL Ex: 250 - 830 nm; FL Em: 270 - 850 nm; Lumi: 300 - 850 nm.
- Dodatkowe funkcje: mieszanie, skanowanie, odczyt kintetyczny; więcej szczegółów można znaleźć tutaj: https://www.moleculardevices.com/products/microplate-readers/multi-mode-readers/spectramax-id3-id5-readers#specifications-options
StepOne Real-Time PCR System (Applied Biosystems) – aparat do qPCR
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne
- Osoba do kontaktu: Anna M. Osyczka, anna.osyczka@uj.edu.pl
EBERS TEB-1000 bioreactor
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne
- Osoba do kontaktu: Anna M. Osyczka, anna.osyczka@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: inkubator CO2 do hodowli komórek z wbudowanymi 2 pompami perfuzyjnymi umożliwiającymi wprowadzenie kontrolowanego, jedno- lub dwukierunkowego przepływu płynów w 2- i 3-wymiarowych hodowlach komórek; więcej szczegółów można znaleźć tutaj: https://ebersmedical.com/tissue-engineering/bioreactors/flow-culture/teb1000
Doświadczenie: prace badawcze w oparciu o ludzkie mezenchymalne komórki macierzyste – ze szpiku kostnego, tkanki tłuszczowej, zębów; badania aktywności biologicznej biomateriałów i substancji aktywnych biologicznie na poziomie komórkowym i molekularnym; mechanizmy osteogenezy w somatycznych komórkach macierzystych;
Drosophila core facility
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne
- Osoba do kontaktu: Milena Damulewicz
- Możliwości badawcze: Profesjonalna zwierzętarnia z hodowlą Drosophila, płytki do usypiania i screeningu fenotypu, mikroskop stereoskopowy fluorescencyjny – screening na obecność GFP, szereg szczepów transgenicznych i mutantów
System do analizy lokomotoryki owadów - DAMS
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne
- Osoba do kontaktu: Milena Damulewicz
- Możliwości badawcze: pomiar aktywności lokomotorycznej, analiza snu przy różnych warunkach świetlnych i temperaturowych
Termocykler z gradientem temperaturowym Sensoquest
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne Osoba do kontaktu: Milena Damulewicz
- Możliwości badawcze: PCR w gradiencie temperaturowym lub bez
System wizualizacji żeli i membran Azure 600
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne
- Osoba do kontaktu: Milena Damulewicz
- Możliwości badawcze: chemiluminescencja, fluorescencja, UV, podczerwień
Inkubator stacjonarny, dwugazowy CO2/O2 do hodowli komórkowych w warunkach hipoksji (od 0.1% do 21% stężenia O2) (model Galaxy 48R) firmy New Brunswick Company)
- Udostępnienie: na zasadzie współpracy/do uzgodnienia
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne
- Osoba do kontaktu: Marek Romek
- Możliwości badawcze: hodowla zarodków.
Mikroskop elektronowy transmisyjny (TEM) Jeol JEM 2100 z przystawką cryo i tomografią wraz z urządzeniami peryferyjnymi (ultramikrotom Leica UC7, trymer, łamarka do noży szklanych Leica EM KMR3, barwienie preparatów Leica EM IGL, Free Substitution System Leica EM AFS2).
- Udostępnienie: wykonywanie zleceń lub na zasadzie współpracy
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne
- Osoba do kontaktu: Elżbieta Pyza, Olga Barczyk-Woźnicka
- Możliwości badawcze: utrwalanie tkanek, komórek do TEM, przygotowanie preparatów (krojenie, barwienie) analiza w TEM.
Mikroskop elektronowy skaningowy (SEM) Jeol JSM-5410 wraz z urządzeniami peryferyjnymi (suszenie, napylanie preparatów złotem Jeol JFC-1100E i węglem Jeol JEC-530)
- Udostępnienie: wykonywanie zleceń lub na zasadzie współpracy
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne
- Osoba do kontaktu: Elżbieta Pyza, Jakub Dymek
- Możliwości badawcze: przygotowanie tkanek, komórek do SEM, przygotowanie preparatów (suszenie, napylanie) analiza w SEM.
Mikroskop konfokalny Zeiss LSM 780
- Udostępnienie: wykonywanie zleceń lub na zasadzie współpracy
- Lokalizacja: Zakład Biologii i Obrazowania Komórki, laboratorium molekularne
- Osoba do kontaktu: Elżbieta Pyza, Paulina Siast-Kuterba
- Możliwości badawcze: utrwalanie tkanek, komórek do mikroskopii świetlnej, przygotowanie preparatów (krojenie skrawków wibratomowych lub mrożeniowych, barwienie – reakcje immunohistochemiczne) analiza w LSM.
Zakład Biologii Rozwoju i Morfologii Bezkręgowców
Ultramikrotom Reichert Jung Ultracut E
- Udostępnienie: Współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: ZBRiMB, Pok. 2.106
- Osoba do kontaktu: mgr Władysława Jankowska (ada.jankowska@uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: ultramikrotom umożliwia przygotowanie preparatów mikroskopowych półcienkich (do obserwacji w mikroskopie świetlnym i fluorescencyjnym) oraz ultracienkich (do obserwacji w mikroskopie elektronowym).
Gel Doc XR+ Gel Documentation System (Bio-Rad)
- Udostępnienie: Współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: ZBRiMB, Pok. 2.126
- Osoba do kontaktu: dr hab. Anna Michalik (a.michalik@uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: System dokumentacji żeli umożliwia szybką i łatwą wizualizację i analizę próbek kwasów nukleinowych i białek.
Fluorometr Qubit 4 (Thermo Scientific)
- Udostępnienie: Współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: ZBRiMB, Pok. 2.126
- Osoba do kontaktu: dr hab. Anna Michalik (a.michalik@uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: Urządzenie umożliwia kwantyfikację kwasów nukleinowych i białek z bardzo dużą dokładnością.
Pracownia Antropologii
Sprzęt do analizy sekwencji DNA i RNA, w tym sekwencjonowania wysokoprzepustowego w zakresie długich i krótkich odczytów.
Komory laminarne do izolacji DNA i RNA oraz przygotowania bibliotek do sekwencjonowania (Thermo Fisher Scientific, MSC-Advantage)
Termocyklery (Therrmo Fisher Scientific, Veriti i SimpliAmp)
Aparat do pomiaru stężenia DNA (Thermo Fisher Scientific, Qubit 4 Fluorometer)
Sekwenator MinION Mk1C CAPEX (Oxford Nanopore Technologies)
- Udostępnienie: Współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: Pracownia Antropologii
- Osoba do kontaktu: Wojciech Branicki (wojciech.branicki@uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: Izolacja DNA, RNA; pomiar stężenia DNA, RNA; przygotowanie bibliotek DNA, RNA; sekwencjonowanie DNA, RNA - długie i krótkie odczyty
Zakład Endokrynologii
Czytnik płytek do pomiaru absorbancji, fluorescencji i luminescencji (Synergy H1, BioTec)
- Udostępnienie: Współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: ZE, pracownia 1.105
- Osoba do kontaktu: Katarzyna Knapczyk-Stwora (katarzyna.knapczyk@uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: Mikropłytkowy czytnik wielodetekcyjny oparty o monochromatory do pomiarów absorbancji, fluorescencji i luminescencji umożliwia wykonanie oznaczeń aktywności enzymów, poziomu wolnych rodników oraz analiz immunoenzymatycznych (np. oznaczanie poziomu hormonów).
Manualny mikrotom rotacyjny (Leica HistoCore BIOCUT)
- Udostępnienie: Współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: ZE, pracownia 1.104
- Osoba do kontaktu: Katarzyna Knapczyk-Stwora (katarzyna.knapczyk@uj.edu.pl)
- Możliwości badawcze: Przygotowanie preparatów z tkanek zatopionych w parafinie/paraplaście do obserwacji w mikroskopie świetlnym i fluorescencyjnym.
Zakład Ewolucji Bezkręgowców
Fluorometr Qubit 4 (Thermo Scientific)
- Udostępnienie: Współpraca po wcześniejszym uzgodnieniu
- Lokalizacja: ZEB, Pok. 3.32
- Osoba do kontaktu: dr hab. Łukasz Michalczyk (LM@tardigrada.net)
- Możliwości badawcze: Urządzenie umożliwia kwantyfikację kwasów nukleinowych i białek z bardzo dużą dokładnością.
Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii
Rama aparatu stereotaktycznego wraz z ramionami (ASI Instruments Inc., USA)
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.32; 0.47
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: Sprzęt umożliwiający rejestrowanie aktywności neuronalnej in vivo na szczurach i myszach pod wpływem narkozy
Rama aparatu stereotaktycznego wraz z ramionami – zautomatyzowany robot stereotaktyczny Neurostar (Neurostar GmbH, Niemcy)
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.42
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl; Dr hab.
- Możliwości badawcze: umożliwia zautomatyzowane
Wzmacniacz sygnałów elektrycznych AM- Systems – dwukanałowy wzmacniacz sygnałów elektrofizjologicznych.
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.32; 0.47; 0.31
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: Może być używany do monitorowania pracy serca (EKG), stanu mózgu (ECoG) zwierzęcia podczas eksperymentu lub do wzmacniania rejestrowanej aktywności neuronalnej
Wzmacniacz juxtacellular NPI (NPI electronics, Niemcy)
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.32; 0.47; 0.31
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: wzmacniacz umożliwiający rejestrację aktywności neuronalnej w trybie juxtacellular. Technika ta pozwala na wyznakowanie neurobiotyną pojedynczej komórki nerwowej, z której prowadzona była rejestracja i późniejsze scharakteryzowanie jej pod względem biochemicznym (przy użyciu immunohistochemii)
System do rejestracji wielokanałowych Plexon, (Plexon, Inc., USA)
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.32; 0.31
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: system do rejestracji macierzami wieloelektrodowymi z mózgu zwierzęcia podczas eksperymentów elektrofizjologicznych in vivo.System umożliwia jednoczesną rejestrację z 32 spotów, współpracuje z macierzami produkowanymi przez firmę NeuroNexus oraz Atlas. Posiada przetwornik analogowo-cyfrowy na poziomie headstagów, co minimalizuje zakłócenia podczas rejestracji. System pracuje w programie OmniPlex, który jest zainstalowany na komputerze stacjonarnym, znajdującym się w pomieszczeniu.
System do mikrojontoforezy NPI (NPI electronics, Niemcy)
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.32
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: umożliwia domózgowe, bardzo lokalne podanie substancji (np. agonistów i antagonistów konkretnych receptorów), które jonizują się w roztworze wodnym. System umożliwia jednoczesną rejestrację aktywności neuronalnej oraz podanie maksymalnie 4 różnych substancji w tym samym czasie. a) ogólne warunki wykorzystania - Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu
Diody do optogenetycznych manipulacji komórkami nerwowymi Plexon (Plexon, Inc., USA)
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.32
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: diody LED umożliwiające stymulację tkanki nerwowej różnymi długościami fali świetlnej (czerwona – 620nm, zielona – 525nm, niebieska dioda – 473nm) u zwierząt wykazujących ekspresję światłoczułych opsyn wbudowanych w błonę komórek nerwowych (tzw. Optogenetyka). Specyfikację można znaleźć pod poniższymi linkami: https://plexon.com/products/plexbright-ld-1-single-channel-led-driver/#1501022219080-2d6b8f7e-e9cf https://plexon.com/products/plexbright-table-top-modules-optogenetic-table-top-modules/ https://plexon.com/products/plexbright-light-measurement-kit/
System do gazowej anestezji małych gryzoni Matrx by Midmark
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.32
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: mieszalnik oraz pochłaniacz gazu anestetycznego, tylko do wykorzystania z izofluranem. Umożliwia przeprowadzenie przeżyciowych operacji stereotaktycznych na uśpionych gryzoniach (szczury) oraz wykonanie kaniulacji, podań domózgowych lub implantacji domórzgowych
Mikroskop do patch clamp Zeiss Examiner A1
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.45; 0.44
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Anna Błasiak anna.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: mikroskop umożliwiający podgląd tkanki mózgowej podczas eksperymentów elektrofizjologicznych ex vivo oraz pozycjonowanie pipety rejestrującej. Mikroskop posiada dodatkowy moduł Colibri, umożliwiający obrazowanie fluorescencji np. w przypadku tkanki mózgowej po transfekcji wektorem wirusowym powodującym ekspresję białka reporterowego.
Wibratom Leica 1000S
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.32
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Anna Błasiak anna.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: wibratom umożliwiający przygotowanie materiału histologicznego do eksperymentów ex vivo.
System do rejestracji wielokanałowych ex vivo multichannel
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.37
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Anna Błasiak anna.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: system do rejestracji macierzami wieloelektrodowymi ze skrawków tkanki mózgowej zwierzęcia podczas eksperymentów elektrofizjologicznych ex vivo. System umożliwia jednoczesną rejestrację z 120 spotów, współpracuje z macierzami produkowanymi przez firmę Multichannel. System pracuje w dedykowanym programie, który jest zainstalowany na komputerze stacjonarnym, znajdującym się w pomieszczeniu.
Wyciągarka do pipet pozioma Sutter Instruments
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.41
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Anna Błasiak anna.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: wyciągarka umożliwiająca przygotowanie mikropipet rejestracyjnych i iniekcyjnych ze szkła borokrzemowego. Istnieje możliwość zapisania konfiguracji własnych parametrów wyciągania i ponowne wczytanie raz zapisanych ustawień przy kolejnym uruchomieniu.
Wyciągarka pionowa Narishige (Narishige, Japonia)
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.32
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: – wyciągarka umożliwiająca przygotowanie mikropipet rejestracyjnych i iniekcyjnych ze szkła borokrzemowego
Drukarka 3d Ender
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.36
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: podstawowy model umożliwiający wydruk elementów w technologii druku 3D przy użyciu filamentu PLA. Obecnie posiadamy biały i czarny filament. Po wcześniejszym kontakcie i uzgodnieniu istnieje możliwość zmiany filamentu na inny kolor.
Mikrotom mrożeniowy
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.33
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: Przygotowanie preparatów mrożeniowych do obserwacji w mikroskopie świetlnym i fluorescencyjnym)
Przetwornik analogowo- cyfrowy Cambridge Electronics Design
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.32; 0.47; 0.31; 0.36; 0.44
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: urządzenie przetwarzające sygnał analogowy na cyfrowy. Posiada funkcję filtracji i wzmocnienia rejestrowanego sygnału (wykorzystywany w rejestracjach in vivo oraz ex vivo z tkanki nerwowej)
Manipulatory manualne Scientifica
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.45; 0.44; 0.36
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl ; Dr hab. Anna Błasiak anna.blasiak@uj.edu.pl
System oświetlenia oczu zwierzęcia LumenXe150C
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.31
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: urządzenie umożliwiające precyzyjne oświetlenie oczu zwierzęcia różnymi długościami fal świetlnych podczas eksperymentów in vivo.
System do fiber photometry RWD
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.46
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl; Dr hab. Tomasz Błasiak tomasz.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: urządzenie umożliwiające pomiar ilości uwolnionego neuroprzekaźnika na podstawie bioluminescencji sensora emitowanej po przyłączeniu przekaźnika. Umożliwia rejestrację sygnału ze zwierząt uśpionych oraz nieuśpionych i wymaga wcześniejszej transfekcji zwierzęcia wirusem powodującym ekspresję sensora w błonie komórek.
Kontroler ciśnienia NeoBiosystems
- Udostępnienie: Na zasadzie współpracy po uzgodnieniu trybu i czasu wykorzystania
- Lokalizacja: Zakład Neurofizjologii i Chronobiologii, pom. 0.45 i 0.36
- Osoba do kontaktu: Prof. Marian Lewandowski, marian.lewandowski@uj.edu.pl; Dr hab. Anna Błasiak anna.blasiak@uj.edu.pl
- Możliwości badawcze: urządzenie umożliwiające zadawanie precyzyjnego nad- i pod-ciśnienia. Używane w trakcie eksperymentów ex vivo (patch-clamp)